ESPCI web site
The aims of this project are:
This project will be supervised by Dr. Nina Ogrinc, Dr. Elena-Sanchez Lopez and Prof. Martin Giera.
Deadline: 30th October 2026
https://www.merit-eu.org/doctoral-candidate-opportunity-11
- To understand how viral infections modulate lipid biosynthetic pathways in neurons and glial cells
- To identify specific lipid classes, species, and metabolites affected by viral infections
- To investigate the therapeutic targeting of lipid metabolism for controlling virus-induced neurodegeneration.
This project will be supervised by Dr. Nina Ogrinc, Dr. Elena-Sanchez Lopez and Prof. Martin Giera.
Deadline: 30th October 2026
https://www.merit-eu.org/doctoral-candidate-opportunity-11
What if an invasive rodent could tell us which chemicals circulate in our environment, and potentially reach our food? LIGER-EXPO uses the coypu (Myocastor coypus) as a sentinel species to characterise exposure to pesticides, POPs, PFAS and emerging contaminants across the Pays de la Loire region, within a One Health framework.
You will:
▪️ develop targeted and non-targeted LC/GC-HRMS methods for internal matrices (liver, adipose tissue)
▪️ evaluate non-invasive matrices (hair, claws) as biomonitoring proxies; the analytical development of PFAS in hair and claws will be carried out by a co-supervised M2 intern
▪️ link contamination profiles to landscape data; the GIS characterisation of sampling sites (QGIS) will be handled by a second co-supervised M2 intern
▪️ coordinate both internships and integrate their results into the overall exposome analysis
▪️ take an active part in public engagement and science communication (European Researchers' Night, Fête de la Science, school visits, "Ma thèse en 180 secondes", Échosciences Pays de la Loire…)
🤝 Partners: VetAgroSup/INRAE RS2GP, BIOEPAR (Oniris/INRAE), POLLENIZ (FREDON Pays de la Loire)
💶 Funding: Région Pays de la Loire & Oniris VetAgroBio
🌍 Opportunity for a research stay in a partner lab abroad (encouraged and supported, but optional)
👤 Profile: Master's degree in analytical, environmental or food chemistry, biochemistry or pharmaceutical sciences, with hands-on mass spectrometry experience. Skills in R are a plus. An interest in science communication is welcome.
📅 Application deadline: 25 October 2026
🗣️ Interviews: 1–15 November 2026
📩 Contact: ronan.cariou@oniris-nantes.fr / meg-anne.moriceau@oniris-nantes.fr
More informations
Nous cherchons un/une étudiant/e pour un post-doc à INRAE Lyon de 18 mois renouvelable 1 fois (3 ans au total). Le descriptif est en pj.
L’objectif du projet postdoctoral est de mettre en œuvre des approches analytiques complémentaires - ciblées, suspectées et non ciblées par HRMS - dans un contexte de rivière urbaine et industrielle, afin i) d’améliorer les connaissances sur la nature et l’étendue de cette contamination sédimentaire, en particulier par les micropolluants émergents, et ii) d’évaluer dans quelle mesure la combinaison de ces approches permet de mieux caractériser les tendances spatiales (avec des sédiments de surface) et temporelles (avec des carottes sédimentaires).
Des compétences en chimiométrie, chimioinformatique et chimiostatistiques sont recherchées.
L’objectif du projet postdoctoral est de mettre en œuvre des approches analytiques complémentaires - ciblées, suspectées et non ciblées par HRMS - dans un contexte de rivière urbaine et industrielle, afin i) d’améliorer les connaissances sur la nature et l’étendue de cette contamination sédimentaire, en particulier par les micropolluants émergents, et ii) d’évaluer dans quelle mesure la combinaison de ces approches permet de mieux caractériser les tendances spatiales (avec des sédiments de surface) et temporelles (avec des carottes sédimentaires).
Des compétences en chimiométrie, chimioinformatique et chimiostatistiques sont recherchées.
Description
L'équipe de bioanalyse des ADCs par spectrométrie de masse du site Eli Lilly de Lyon recrute un(e) technicien(ne) pour un contrat en CDD de 12 mois, à pourvoir fin 2026. Vous participerez aux analyses LC-MS (QTOF, Orbitrap, Triple Quad) : quantification de payload libre, analyses de DAR, études de stabilité. Profil Bac+3 chimie/biochimie recherché.
Description
Contexte : La création de bases de données de spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) est un enjeu majeur pour l’entrainement de modèles d’IA afin de prédire la structure des petites molécules. La constitution de telles bases de données nécessite le développement de workflows computationnels pour planifier les acquisitions, traiter les données, et les formater.
Sujet : L’ingénieur·e sera chargé·e de développer les workflows computationnels haut-débit pour traiter ces données, créer les bases de données et les diffuser dans la communauté.
Profil : Nous recherchons un·e ingénieur·e bioinformaticien·ne avec une solide formation en programmation Python, traitement des données, gestion de workflow (e.g., Nextflow, Galaxy) et bases de données (e.g., PostgreSQL), et si possible une expérience des données de spectrométrie de masse MS/MS.
Laboratoire d’accueil : L’équipe Odiscé du CEA Saclay, membre de l’infrastructure nationale de métabolomique MetaboHUB, est spécialisée depuis plus de 15 ans dans le développement de méthodes en informatique mathématique (traitement du signal, machine learning, chémoinformatique, gestion de workflows) et de librairies logicielles innovantes en sciences des données de spectrométrie de masse pour la métabolomique de population.
Durée : 24 mois
Date de début du contrat : janvier 2027
Date limite de candidature : 30/10/2026
Contact : Merci d’adresser votre candidature (CV détaillé avec les expériences professionnelles, lettre de motivation, coordonnées des personnes référentes) à :
Etienne Thévenot (etienne.thevenot@cea.fr)
Equipe sciences des données de spectrométrie de masse pour la métabolomique (Odiscé)
Laboratoire Innovations en spectrométrie de Masse pour la Santé (LI-MS)
CEA, Centre de Saclay, F-91191 Gif sur Yvette, France
Team: https://odisce.github.io/
GitHub: https://github.com/odisce